电子保函是一种电子商务或信用服务工具，相关业务必须遵守《中华人民共和国合同法》、《中华人民共和国担保法》、《中华人民共和国电子签名法》以及电子商务有关法律法规的规定，遵循PKI体系的数字签名系统和数字证书技术标准和规范。通过担保机构企业数字证书为受益人签发的具有担保机构电子签名的电子保函，可以保证电子保函的真实性、防伪性、不可篡改性和不可抵赖性，与纸质保函具有同等的法律效力，同时可以进行第三方电子保函存证备案，具有、快捷、保密、全生命周期低成本、可信赖的优点。
海关总署是国内较早推广使用电子保函的政府部门，率先明确规定了电子保函业务，并成功地与金融机构合作开展了电子保函服务，开展在京津冀、长江经济带和广东地区区域通关一体化改革，在区域内海关推动电子保函“一关备案、区域通用”改革试点，打破关区界限，降低通关成本，促进贸易便利化。
预付保函又称还款保函（repayment guarantee）及退款保函，在贸易合同中还可以称为定金保函（down-payment guarantee）。在大额交易中，买方或业主在合约签订后的一定时间内预先需向供货方支付一定比例的款项作为执行合同的启动资金，由于该款项是对供货方在履约之前所作的预付，买方为了避免日后由于供货方拒绝履行义务或者无法履行义务，却不退款而无端遭到损失，通常要求供货方在买方预付之前的若干日内通过其银行开出预付保函，由银行作出承诺，一旦申请人未能履约或者是无法全部履约（不管这种行为是有意的或者是无意造成的），担保行将在收到买方提出的索赔后，向其返还这笔与预付金额等值的款项，或者相当于合约尚未履行部分相当比例的预付金额，使买方能够顺利的收回所预付的款项。
商业保函与银行保函的因素
签发者: 商业保函是由商业公司或保险公司签发的，银行保函则是由银行签发的。
保证内容: 商业保函主要是对货物交付的保证，而银行保函主要是对债务偿还的保证。
保证范围: 商业保函的保证范围比较灵活，可以针对特定交易、地域或商业关系；银行保函通常是对整体债务的保证。
保证效力: 商业保函的效力可以通过保险公司的信用评级来评估，银行保函则受银行的信用评级影响。
权利义务: 商业保函一般不涉及银行的财务责任，银行保函则是银行承担的保证责任。
这些因素需要根据具体交易情况进行考虑，并结合客户的需求来选择适合的保函类型。