北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心二病区拥有的胃肠肿瘤诊疗和研究团队，比肩国际胃肠诊疗中心。共开放床位29张，专长于进展期胃肠肿瘤的手术和综合、早期胃癌的保留功能手术、低位直肠保肛手术等。主治病种包括胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤和其他少见胃肠道肿瘤。在多学科讨论的基础上，为每一位患者制定和实施为合理的诊疗规划。在中心主任季加孚院长的直接领导下，科室秉承北京大学肿瘤医院的优良传统，追求，不断进步，在临床、科研、教学等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持稳健、严谨工作作风的同时，走上了高速发展的快车道。科室人员结构：1、人员构成：主任医师3人，副主任医师6人，主治医师7人，住院医师2人，护理人员17人。2. 科室主要领导：胃肠肿瘤中心主任季加孚，科主任步召德，护士长赵旻。
科室特色包括：微创手术、外科、疑难手术、功能保留手术、快速康复、病人全程管理。
家族遗传性肿瘤中心旨在为家族遗传性乳腺癌患者和高风险人群提供遗传咨询，易感基因检测和结果解读, 风险评估和家系管理，以及的个体化。为携带BRCA1/2突变的高风险健康女性提供乳腺癌发病风险评估和早期诊断，以及可能的预防性干预措施，包括双侧乳腺预防切除及I期重建。为携带突变的乳腺癌患者提供适宜的手术方式，在充分评估对侧乳房发病风险的前提下，为其提供对侧乳腺预防切除和I期重建， 以及针对性的辅助化疗和潜在的靶向，使家族遗传性乳腺癌患者获得的效果。学科带头人解云涛教授长期致力于家族遗传性乳腺癌的研究和临床诊治。率先在国内开展乳腺癌易感基因BRCA1/2的临床检测及临床实践，领导的团队完成了国内宗的乳腺癌易感基因检测， 在家族遗传性乳腺癌的诊治方面积累了丰富经验。本中心将秉承“患者利益，努力方向”的宗旨，竭诚为家族遗传性乳腺癌患者提供优质的专业化临床服务。
本中心开展下列特色医疗服务：
1. 遗传咨询
2. 乳腺癌易感基因BRCA1/2的检测及结果的专业解读
3. 高风险个体乳腺癌发病风险的评估及预防干预建议
4. BRCA1/2突变健康女性的乳腺预防切除及I期重建
5. BRCA1/2突变高风险家系的健康管理及优生优育
北京大学肿瘤医院淋巴瘤科是我国成立早的淋巴瘤专业科室，经历了36年的发展历程，已经成为我院的特色品牌科室之一，目前拥有普通病床36张，移植舱位4张，专业从事淋巴瘤的临床诊断与、以及自体干细胞移植。收治患者全部为各类型淋巴瘤患者，几乎涵盖世界卫生组织淋巴瘤分类的全部亚型。
我科现有临床医生12人，其中正副主任医师7人、主治医师4人、住院医师1人;护士20人，专业科研人员和技术员各1人，科研护士2人。每年门诊接诊4000人次，新收治住院淋巴瘤患者400例，每月出院患者约200人次。
为了给患者提供更好的个体化综合诊治平台，2005年，以淋巴瘤科为主成立了院内淋巴瘤专业协作组，包括淋巴瘤内科、病理科、外科、放疗科、影像科、核医学科等等，对疑难病例进行全院会诊讨论。
在繁忙的日常工作之外，为了提高淋巴瘤的水平，促进学科发展，也为了给患者提供更多的机会和措施，我科先后承担了30余项国内外新药临床研究。同时作为医院品牌科室和国内少数淋巴瘤专业科室之一，承担了大量北京及外省市疑难病例会诊工作和学术讲座;承担北京大学医学部硕士、博士研究生及住院医师、进修医师、访问学者的部分培训工作;定期为患者及家人举办康复课堂教育活动等等。
感谢患者及家人的支持和理解，也感谢国内外同道的关注和鼓励，淋巴瘤科将继续秉承我院“院有品牌、科有特色、人有专长”的办院宗旨，为来自国内外的淋巴瘤患者提供优质规范的医疗服务和人性化的关怀照顾。
北京大学肿瘤医院放疗科始建于1976年，同年，我国台直线加速器在这里自主研制成功。
放疗科2000年即在国内较早开始开展三维立体定向适形放疗， 2004年在北京市率先开展三维适形动态调强放射，迄今采用调强放疗技术患者超过13000例，并取得良好的疗效。2008年放疗科引进了具有功能的后装机、大孔径CT定位机和20套先进的计划系统， 2009年国内台VMAT在我放疗投入使用;2011年国内台True Beam投入使用;2012年引进国内首套大孔径核磁定位系统放射，在放疗设备的配置方面达到了国际先进水平。